2006年5月22日～5月23日，我所接受了新時代認證中心質量管理體系第2次監督審核。審核組由高級審核員袁錫桂、劉勁林組成，被審核部門包括科研質量處、條件保障處、人力資源處、八室等部門。審核組還分別與所領導與軍代表進行了座談。
審核組對現場監督審核給予了高度評價，認為我所質量管理體系取得了重大進步，年度的質量目標得到了貫徹和實施，產品實現過程受控，顧客對產品質量和服務質量滿意，有效開展了內部審核與管理評審，自我完善能力強。審核組確認我所質量管理體系符合GJB9001A-2001標準要求，質量管理體系運行適宜、充分并有效，保持認證要求。